La aldea de San Isidro se erigió en pueblo poco antes de la emancipación política y ya figura como tal y como cantón electoral en la ley de 18 de febrero de 1873. Perteneció al Departamento de San Vicente desde el 12 de junio de 1824 hasta el 10 de febrero de 1873, fecha en que ingreso en el departamento de Cabañas. Por decreto Legislativo del 7 de febrero de 1879 se le otorgó el título de villa al pueblo de San Isidro y en 1998 se le otorgó el título de ciudad

Antecedentes históricos

El origen de esta población fue el avecindamiento de varias familias de ladinos en el paraje que hoy ocupa, a mediados del siglo XVIII. En 1807, San Isidro era una aldea de ladinos en el partido de Sensuntepeque; la aldea de San Isidro se erigió en pueblo poco antes de l emancipación política (1821) y ya figura como tal y como cantón electoral en la ley del 18 de febrero de 1841.

Perteneció al departamento de San Vicente desde 1824 (12 de junio) hasta 1873 (10 de febrero), en esta última fecha ingreso en el departamento de Cabañas.

Cabecera municipal: Ciudad de San Isidro

La cabecera es la ciudad de san Isidro, situada a 370 msnm y 11 km al sureste de la ciudad de Sensuntepeque. Sus coordenadas geográficas centrales son: 13°49´54” LN. Y 88°43´09” LWG. Se divide en dos barrios El centro y el Calvario. Las calles más importantes son Calles Boanerges Bautista Chávez. Pte. y Ote. Av. 15 de mayo Norte y sur

Gobierno local

El gobierno local lo ejerce un concejo municipal integrado por un alcalde, un sindico y varios regidores